La malattia da reflusso gastro esofageo non è di per se una patologia di interesse chirurgico ma viene egregiamente trattata dai gastroenterologi e tenuta sotto sorveglianza endoscopica.

Quando la malattia da reflusso è complicata dalla presenza di un’ernia iatale o da una condizione di Esofago di Barrett (condizione in cui la normale mucosa squamosa pluristratificata dell'esofago tubulare distale viene sostituita, per una lunghezza di almeno 3 cm dalla giunzione gastro-esofagea, da epitelio cilindrico) allora deve essere attentamente valutata l’indicazione ad un intervento chirurgico.  È ormai dimostrato che l'esofago di Barrett è una condizione acquisita, risultante da un reflusso gastro-esofageo cronico, con la successiva distruzione del normale epitelio e la sua sostituzione con cellule cilindriche risalenti dalla giunzione gastro-esofagea: sono necessari prelievi bioptici seriati (ogni cm dalla giunzione esofago-gastrica) per la documentazione della malattia e della eventuale displasia o degenerazione. L'esofago di Barret costituisce una lesione pre-cancerosa con una possibile progressione a displasia lieve, media e grave, e a neoplasia: vi è un generale consenso sulla necessità di trattamento aggressivo in ogni caso di esofago di Barrett classico (> 3 cm).

Nelle persone affette da esofago di Barrett, il tessuto che riveste l’esofago (il tubo che collega la bocca allo stomaco) viene sostituito da cellule simili a quelle che si trovano nel rivestimento dell’intestino, che tuttavia in questo caso sono di fatto precancerose; questa trasformazione purtroppo non è associata a specifici sintomi, ma un paziente che ne viene colpito spesso manifesta sintomi di grave reflusso gastroesofageo: